Anabole steroider påvirker ikke kun musklerne, men også mange af kroppens organer. Derfor er listen over mulige bivirkninger lang. Nogle kan aftage, når man stopper med at tage dem, mens andre kan være permanente.
Den største risiko vedrører hjertet. Steroider kan sænke det »gode« HDL-kolesterol, øge det »dårlige« LDL-kolesterol og få blodtrykket til at stige. Med tiden kan hjertevæggen blive tykkere og stivere. Brugere har øget risiko for hjerteanfald, hjertemuskelsygdomme, hjerterytmeforstyrrelser og hjertesvigt.
Steroider kan øge antallet af røde blodlegemer. Hvis antallet stiger for meget, bliver blodet mere tyktflydende. Det kan øge risikoen for blodpropper, som kan føre til et slagtilfælde, en lungeemboli eller et hjerteanfald.
Kroppens egen testosteronproduktion kan falde kraftigt under brugen. Testiklerne kan skrumpe, og sædproduktionen kan falde markant. Mange mænd bliver midlertidigt infertile. Det kan tage måneder at komme sig efter ophør, og hos nogle sker det ikke fuldstændigt.
En del af testosteronet omdannes til østrogen. Det kan medføre vækst af brystvæv hos mænd – såkaldt gynækomasti. Når der først er dannet egentligt kirtelvæv, forsvinder det ofte ikke af sig selv og kan kræve medicinsk behandling.
Især orale steroider kan belaste leveren kraftigt. Mulige følger er nedsat galdeafløb, blodfyldte hulrum i leveren og i sjældne tilfælde levertumorer. Leverskader giver ofte først symptomer, når de allerede er fremskredne.
Langvarig brug kan skade nyrerne. Hos brugere af steroider er der beskrevet arvævsdannelse i nyrelegemerne og tab af nyrefunktion, især i kombination med meget stor muskelmasse og en proteinrig kost.
Kraftig akne, især på ryg, bryst og skuldre, er almindelig. Fedtet hud og strækmærker kan også forekomme. Ved arvelig disposition kan steroider fremskynde hårtab.
Steroider kan stimulere væksten af prostata. Det kan føre til forstørret prostata og problemer med vandladningen.
Kvinder er følsomme over for de maskuliniserende virkninger. Mulige forandringer omfatter en dybere stemme, ansigts- og kropsbehåring, en forstørret klitoris, uregelmæssige eller udeblevne menstruationer samt hårtab efter mandligt mønster. Især den dybere stemme kan være permanent.
Hos unge, der stadig vokser, kan steroider få knoglernes vækstzoner til at lukke for tidligt. Derfor når de muligvis ikke deres fulde højde.
Steroider påvirker også hjernen. Mulige følger er irritabilitet, aggressivitet, angst, humørsvingninger og søvnproblemer. Nogle brugere udvikler afhængighed og kan have meget svært ved at stoppe.
Efter ophør har kroppens egen hormonproduktion brug for tid til at komme sig. I denne periode kan der opstå træthed, nedsat sexlyst, rejsningsproblemer, nedtrykthed og undertiden depression. Desuden kan en del af den opbyggede muskelmasse gå tabt igen.
Usterile injektioner kan forårsage bylder og farlige infektioner. Deling af nåle eller ampuller kan overføre HIV samt hepatitis B og C. En injektion det forkerte sted kan skade en nerve eller et blodkar.